Функциональные генетические последовательности слишком редки, чтобы эволюционировать друг от друга

Заявление:

Для эволюции необходимо, чтобы белковые последовательности претерпевали весьма существенные изменения, при которых все промежуточные состояния этих последовательностей оставались бы функциональными. Но из всех возможных последовательностей функциональные последовательности встречаются чрезвычайно редко, поэтому большинство функциональных последовательностей крайне изолированы друг от друга. Используя язык в качестве аналогии, одно предложение не может превратиться в другое посредством постепенных изменений, поскольку все эти промежуточные состояния будут бессмысленными. Крайне невероятно, чтобы случайные мутации могли изменить одну функциональную последовательность на другую.

Ответы

1. Функциональные последовательности не настолько редки и изолированы. Эксперименты показывают, что около 1 из 1011 всех случайных белковых последовательностей обладает способностью связывания АТФ (Keefe and Szostak 2001), и теоретическая работа П. Йоки (P. Yockey, 1992, 326-330) показывает, что около такого уплотнения все функциональные последовательности связаны единичными изменениями аминокислот. Кроме того, имеется несколько типов мутаций, которые одновременно изменяют несколько аминокислот. Моделирование дупликации и дивергенции кишечной палочки, основанное на опубликованных измерениях мутантов, показывает, что при эволюции новой функции нейтральные и вредные мутации играют ничтожную роль (Poelwijk et al. 2006).

2. Имеется множество данных, показывающих, что новые гены с новыми функциями могут эволюционировать и эволюционируют. Даже произвольная генетическая последовательность может эволюционировать, получая функциональность (Hayashi et al. 2003). Направленная эволюция в пробирке является мощным и всё более популярным методом получения новых генов и полезных генных продуктов (Joyce 2004; Schmidt-Dannert 2001; Tao and Cornish 2002). Направленная эволюция может работать, даже начиная со случайной последовательности. Эволюция новых последовательностей не может быть очень невероятной, если она происходит настолько легко и настолько часто.

3. Аналогия с языком неточна. Белки являются более гибкими. Они могут сильно отличаться в своих последовательностях, даже до семидесяти-восьмидесяти процентов и более, и тем не менее обладать той же функцией.

4. Дентон (Denton, 1998, 276) писал: "Одним из самых удивительных открытий, возникшим при секвенировании ДНК, было замечательное обнаружение, что геномы всех организмов сгруппированы очень близко друг к другу в крошечном пространстве последовательностей ДНК, формируя дерево связанных последовательностей, которые могут переходить друг в друга посредством ряда малых дополнительных естественных шагов". Мейер (Meyer) цитирует более старую работу Дентона (1986) без оповещения читателей об изменившихся взглядах Дентона. Ныне Дентон критикует сторонников разумного замысла за игнорирование ними неоспоримых данных (Denton 1999).